Brustkrebs umfasst eine Gruppe sehr heterogener Erkrankungen, die sich auf molekularer, histopathologischer und klinischer Ebene nachweisen lassen. Die Heterogenität auf molekularer Ebene wurde durch reproduzierbare Unterschiede in der Häufigkeit und dem Ausmaß genomischer Aberrationen und durch eine unterschiedliche Genexpression bei Brustkarzinomen nachgewiesen, selbst bei solchen mit ähnlicher Histologie. Studien zur Ganzgenomanalyse mit Hilfe von Expressions-Microarrays haben unser Verständnis des Mammakarzinoms revolutioniert und zur Entdeckung von fünf verschiedenen Subtypen des Mammakarzinoms geführt (Luminal A, Luminal B, HER2-Überexpression, basal-ähnlich, normal-ähnlich), von denen jeder seinen eigenen erkennbaren Phänotyp und klinischen Ausgang hat. Spätere Studien haben gezeigt, dass Brustkarzinome auch in fünf ähnliche Untergruppen eingeteilt werden können, wobei die immunhistochemische (IHC)-Analyse als Surrogat mit einer begrenzten Auswahl an Antikörpermarkern (einschließlich ER, PR, HER2, CK5/6 und EGFR) verwendet wird. Diese Untergruppen zeichnen sich durch Merkmale aus, die eng mit den durch Genexpressionsprofile definierten Subtypen verbunden sind. Dazu gehören unterschiedliche klinische Ergebnisse, unterschiedliches Ansprechen auf eine adjuvante Therapie und unterschiedliche Muster des Wiederauftretens von Metastasen.